COVID-19 : la salive comme possible identifiant prédictif de la personne gravement malade
Salive et COVID-19 : avec les mêmes symptômes, certaines personnes atteintes du SRAS-CoV-2 doivent être hospitalisées tandis que d'autres peuvent être traitées à domicile
Ce qui distingue les deux groupes et comment les identifier rapidement afin d'orienter les choix thérapeutiques des médecins fait l'objet d'une recherche Humanitas, publiée dans Gastro Hep Advances, qui décrit une nouvelle méthode basée sur l'analyse de la salive et du sang.
Le coordinateur de l'étude est le professeur Maria Rescigno, chef du Laboratoire d'immunologie muqueuse et du microbiote d'Humanitas et professeur de pathologie générale à l'Université Humanitas, qui, avec son équipe de chercheurs, a rejoint le Dr Antonio Voza, chef du service des urgences Humanitas, et le Dr Elena Azzolini, responsable du Centre de vaccination Humanitas.
Les résultats de l'étude sur les écouvillons Covid et la salive
Face aux difficultés des premières vagues pandémiques, alors que des milliers de malades affluaient urgences et qu'il y avait encore peu de connaissances sur l'évolution de la maladie, l'équipe de chercheurs a utilisé son expertise sur le microbiote et les muqueuses pour identifier de nouveaux marqueurs de gravité qui fonctionneraient précocement.
Le professeur Maria Rescigno et le Dr Chiara Pozzi, chercheuse immunologiste à Humanitas, se sont concentrées sur le microbiote de la salive et l'ensemble des métabolites, c'est-à-dire les produits résultant d'un processus chimique lié à la digestion ou à l'ingestion d'aliments.
"A travers une étude rétrospective, nous avons analysé la salive et le sang de patients hospitalisés et soignés à domicile pour savoir ce qui distinguait les deux groupes, en comparant les données avec celles recueillies auprès de sujets sains et guéris", explique le professeur Rescigno.
« Une approche de machine learning était essentielle : nos data scientists, dirigés par Riccardo Levi, nous ont aidés à éliminer les paramètres confondants et le facteur âge, nous permettant d'isoler deux métabolites, le myo-inositol et l'acide 2-pyrrolidinique acétique.
Celles-ci, associées à une protéine présente dans le sang (Chitinase 3-L1), se sont avérées corrélées à la sévérité du COVID-19, et donc au besoin ou non d'hospitalisation ».
La combinaison de ces 3 paramètres salivaires et sanguins décrit l'identité du patient gravement malade et permettrait ainsi de distinguer les patients Covid en fonction de l'attente de leur évolution clinique.
"Par la suite, nous avons vu que ces deux métabolites étaient corrélés à certains groupes de bactéries du microbiote salivaire", poursuit le professeur Rescigno.
« Ceux qui ont des métabolites modifiés ont également des bactéries modifiées.
Le résultat n'est pas surprenant : le microbiote joue un rôle important dans l'infection car il prépare le système immunitaire et peut avoir des activités antimicrobiennes.
Et la salive, où se trouve une partie du microbiote, est l'un des endroits où le virus pénètre
« Il est également important de noter que la protéine détectée dans le sang est impliquée dans la régulation du récepteur ACE2, le récepteur du virus SARS-CoV-2.
Cela signifie que si la protéine est déjà élevée au départ, la personne a plus de récepteurs et pourrait donc "laisser entrer" plus de virus.
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