Bactériothérapie fécale : transplantation fécale pour Clostridium difficile, colite et maladie de Crohn
La bactériothérapie fécale, également appelée transplantation fécale ou transfusion fécale ou infusion de probiotiques humains (HPI) ou transplantation de microbiome fécal, est un traitement médical non médicamenteux, en phase expérimentale, utilisé avec une certaine efficacité chez les sujets atteints de colite pseudomembraneuse soutenue par le Bactérie Clostridium difficile (récemment renommée « Clostridium difficile ») ; ou encore en cas de rectocolite hémorragique réfractaire aux thérapies courantes
L'objectif de cette thérapie innovante est de restaurer l'écologie microbienne et l'homéostasie du côlon en réintroduisant un microbiote humain sain (équilibré), prélevé dans les fèces d'un donneur sain ou dans certains cas à partir de fèces préalablement "données" par le même sujet ( homotransfusion ou restauration autologue de la flore gastro-intestinale – ARGF).
La justification théorique de cette technique thérapeutique se trouve dans les recherches les plus avancées sur l'utilisation des probiotiques et les études sur le microbiome, qui est l'ensemble des micro-organismes : bactéries, archéobactéries, champignons, virus, présents dans un environnement spécifique (en l'occurrence cas le milieu fécal).
Il est bien connu qu'une bonne écologie microbienne peut repousser la prolifération d'organismes pathogènes.
Dans le côlon, on estime qu'il existe 500 à environ 1000 espèces différentes de bactéries avec un total de 1013 bactéries.
En effet, le microbiome doit être considéré comme une entité biologique à part entière, symbiote avec l'organisme hôte.
Le complexe bactérien ou microbiome agit dans le maintien de l'homéostasie de l'organisme hôte ; cette flore microbienne est relativement inoffensive lorsqu'elle est réintroduite dans l'organisme.
On ne sait pas grand-chose sur le rôle du microbiome, cependant, de nombreuses espèces animales herbivores et non herbivores sont connues pour avoir des habitudes coprophages, probablement dues à un double cycle digestif (double digestion).
Transplantation fécale : le principal avantage de la bactériothérapie fécale est de réduire le risque d'induire une résistance aux antibiotiques chez les bactéries hautement pathogènes
D'autres avantages sont un coût relativement faible, pas besoin de médicaments et une bonne efficacité (à confirmer – cependant – avec des études plus larges) pour le traitement des cas où la résistance aux antibiotiques existe.
Cependant, la méthode est toujours considérée comme un traitement de "dernier recours" en raison de son caractère plus invasif par rapport au traitement conventionnel avec des antibiotiques et des risques potentiels de transmission d'infections (bactéries, virus, prions, parasites intestinaux).
Bien que l'expérience de la bactériothérapie fécale soit encore limitée, les résultats publiés sur la procédure montrent que plus de 80 patients ont démontré un taux de réussite moyen de plus de 90 %
La bactériothérapie fécale est une procédure rudimentaire et facile à réaliser qui peut briser les cycles d'utilisation répétée d'antibiotiques, ce qui réduit à son tour le risque d'apparition récente d'une résistance aux antibiotiques.
Il a également le potentiel de réduire les coûts, par rapport aux administrations répétées d'antibiotiques avec les hospitalisations nécessaires.
Colite pseudomembraneuse
L'importance en tant qu'agent pathogène de Clostridium difficile (CDI) est solidement établie depuis 1978, mais l'importance de cette technique dans le traitement de la colite pseudomembraneuse découle également du fait que son épidémiologie a récemment changé, posant de sérieux problèmes diagnostiques et thérapeutiques aux cliniciens. .
Les taux d'infection (ICD) ont doublé, passant de 31/100,000 1996 en 61 à 100,000/2003 XNUMX en XNUMX.
Au cours des dernières années, la gravité et la mortalité de l'infection par C. difficile ICD ont augmenté et cela a été attribué à une nouvelle souche virulente de C. difficile connue sous le nom de souche nord-américaine d'électrophorèse en champ pulsé de type 1 (NAP-1) ou également PFGE type BI/NAP1 ribotype 027.
Le caractère unique de la souche NAP-1 réside dans sa production accrue de toxines A et B et sa production de toxines binaires et sa résistance à la fluoroquinolone.
Les souches hypervirulentes NAP1 de C. difficile sont responsables de la majorité des épidémies nosocomiales récentes, et l'utilisation généralisée des antibiotiques fluoroquinolones peut avoir facilité la prolifération sélective de cette souche.
La souche NAP1 est également plus susceptible de provoquer une colite sévère et fulminante caractérisée par une leucocytose marquée, une insuffisance rénale aiguë, une instabilité hémodynamique et un mégacôlon toxique.
C. difficile est devenu la cause bactérienne la plus courante de diarrhée nosocomiale.
L'infection à Clostridium difficile est à l'origine de la DACD (Clostridium difficile Associated Disease) ou plus rarement de la colite pseudomembraneuse, qui est une pathologie grave entraînant une morbidité et une mortalité importantes, notamment chez les patients sous traitement antibiotique ou les patients cancéreux subissant une greffe de cellules souches, voire chez les patients subissant une radiothérapie .
La fréquence accrue des infections par des souches hypervirulentes de C. difficile a entraîné des complications et des échecs thérapeutiques avec les traitements conventionnels par métronidazole et vancomycine.
Bien qu'avec une expérience clinique limitée, il a été démontré de manière préliminaire que la bactériothérapie fécale fournit des taux de guérison clinique élevés, cependant, les essais cliniques randomisés pour cette approche thérapeutique font défaut à ce jour.
La colite ulcéreuse
Dans la colite ulcéreuse, aucun agent pathogène n'a été trouvé à ce jour.
Mais l'efficacité de la bactériothérapie fécale dans ce cas laisserait penser que la cause de la colite ulcéreuse pourrait être due à une infection antérieure par un agent pathogène resté inconnu.
En effet, l'infection initiale peut probablement s'être résolue naturellement chez ces patients ; mais parfois, un déséquilibre de la flore intestinale du côlon peut entraîner une poussée inflammatoire (ce qui expliquerait le caractère cyclique et récurrent de cette maladie).
Ce cycle semble, au moins dans de nombreux cas, être interrompu en recolonisant le côlon du patient avec un complexe bactérien (probiotique) prélevé sur un intestin sain (hétérogreffe).
Certains médecins estiment que ce traitement réalisé chez des sujets sains est sans danger et de nombreux patients pourraient bénéficier de cette thérapie innovante.
Une étude de mai 2011 a confirmé la bonne volonté des patients et des parents d'enfants atteints de rectocolite hémorragique à accepter ce traitement, une fois surmonté leur aversion initiale pour la méthode.
En 2013, une autre recherche a confirmé la validité de la thérapie avec une étude pilote prospective sur dix sujets âgés de 7 à 21 ans.
Cette étude démontre la tolérabilité et l'efficacité de la thérapie de transplantation fécale dans la rectocolite hémorragique ; en fait, chez sept sujets, il y a eu une rémission clinique en une semaine et six sur neuf ont maintenu une rémission clinique à un mois.
Transplantation fécale, autres maladies étudiées pour la bactériothérapie fécale
La technique est actuellement étudiée chez des sujets atteints de la maladie de Parkinson, du diabète, de l'obésité, du syndrome du côlon irritable, de la maladie inflammatoire chronique de l'intestin, de la sclérose en plaques, du purpura thrombocytopénique idiopathique, de la maladie de Crohn, de la résistance à l'insuline et du syndrome de fatigue chronique.
Procédure classique
Normalement, les matières fécales d'un parent proche et sain du patient sont utilisées après avoir recherché et exclu la présence de bactéries contagieuses ou de virus ou de parasites tels que : Salmonella, virus de l'hépatite, etc.
Après prélèvement, l'échantillon de selles est traité et préparé dans un laboratoire clinique sous la forme d'une suspension liquide, qui est ensuite instillée dans le tractus gastro-intestinal supérieur via une sonde nasogastrique qui remonte jusqu'au niveau du caecum.
La procédure implique parfois 5 à 10 jours de traitement avec des lavements, réalisés avec du microbiote humain issu des fèces d'un donneur sain ; la plupart des patients se rétablissent après un seul traitement.
Le meilleur choix de donneur est un parent proche qui a été testé pour un large éventail d'agents bactériens et parasitaires.
Les lavements sont préparés et administrés en milieu hospitalier afin d'assurer tous les soins nécessaires.
L'infusion du probiotique peut également être effectuée par une sonde nasogastrique, délivrant les bactéries directement dans l'intestin grêle.
Les deux méthodes peuvent être combinées pour obtenir le meilleur résultat.
Des contrôles réguliers doivent être effectués jusqu'à un an après la procédure.
ARGF (restauration autologue de la flore gastro-intestinale)
Une forme modifiée de bactériothérapie fécale, actuellement en cours de développement, est la restauration autologue de la flore gastro-intestinale (ARGF).
Cette méthode est plus sûre, plus efficace et plus facile à administrer.
Un échantillon fécal autologue (propre) est fourni par le patient avant le traitement médical et conservé dans un réfrigérateur.
Si le patient développe par la suite une pathologie C. difficile, l'échantillon est extrait avec une solution saline et filtré. Le filtrat est lyophilisé et le solide résultant est enfermé dans des capsules gastro-résistantes.
L'administration des gélules restaure la propre flore colique du patient, ce qui est utile pour lutter contre toute infection à C. difficile qui aurait pu s'installer.
Cette procédure évite les risques de la bactériothérapie fécale classique, où une éventuelle infection pourrait être transmise au patient par le donneur, et évite également la nécessité d'administrer l'échantillon fécal dans le duodénum via une sonde gastrique.
Efficacité
L'efficacité de la méthode dans la prévention des récidives de colite pseudomembraneuse est estimée à environ 90 %.
Une étude de décembre 2011 confirme ces données montrant une efficacité de la méthode de 92 % dans la prévention de la diarrhée ou de nouvelles récidives dans un groupe de 26 patients présentant des infections récurrentes à C. difficile.
Une étude finlandaise de 2011 souligne que le traitement antibiotique des infections récurrentes à Clostridium difficile (ICD) entraîne des récidives chez 50 % des patients.
L'utilisation de la transplantation fécale lors d'une procédure de test de coloscopie après une préparation intestinale avec du polyéthylène glycol (lavage) a entraîné une résolution de 89 % des cas de colite pseudomembraneuse récurrente à un an de suivi, soulignant que les cas traités étaient causés par un souche de C. difficile particulièrement virulente (type 027).
Toujours en décembre 2011, une revue de 317 patients a montré une efficacité de 92% de la méthode, montrant également peu d'effets secondaires.
En 2015, une étude comparative avec la vancomycine a été publiée montrant la supériorité de la fécale bactérienne sur cet antibiotique.
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