Analisi genomica del Sars-Cov-2 dal Cnr: un team di ricercatori dell'Istituto di biomembrane, bioenergetica and biotecnology molecolari del Consiglio nazionale delle ricerche (Cnr-Ibiom) di Bari, dell'Universita 'Aldo Moro di Bari e del Dipart bioscienze dell'Universita 'Statale di Milano ha Recentemente sviluppato un nuovo strumento yazılımı için kolaylıklar l'analisi del genoma del coronavirus SARS-CoV-2, l'agente patogeno che Causa il COVID-19.

SARS-CoV-2, lo studio Cnr e 'stato pubblicato sulla rivista Biyoinformatik

Durante la pandemia sono stati sequenziati e resi disponibili piu 'di 400 mila sequenze genomiche appartenenti a differenti papi del patogeno isolati in the different regionic del mondo.

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Katkıda bulunan bir kişi için bir araştırma, gli autori dello studio hanno sviluppato CorGAT (Coronavirus Genom Analysis Tool), uno strumento dotato di un'interfaccia web che ne facilita l'utilizzo e accessibile a tutta la comunita 'Scientifica.

"CorGAT consente di uno o piu 'virus in pochi Seconded esegue in maniera rapida e veloce l'annotazione funzionale del genoma di SARS-CoV-2, un processo che e' in grado di identificare le principali differentenze tra i Genomi di diversi ceppi del virus ve predirne le possibili implicazioni funzionali ”, afferma Graziano Pesole del Cnr-Ibiom.

“Lo strumento e 'stato sviluppato per an la maggiore quantita' di informazioni possible and integra una serie di risorse e system originali per l'annotazione del genoma.

Allo stato attuale CorGAT e 'probabilmente il piu' aggiornato e doğru sistema per eseguire questo tipo di analisi ”.

SARS-CoV-2 ile ilgili Con CorGAT Cnr

Uygulama CorGAT a piu 'di 50.000 sequenze genomiche, gli autori dello studio sono stati in grado di delineare le dinamiche evolutive di SARS-CoV-2 e di individuare le regioni del genoma che birikulano piu' mutazioni.

"La parte piu 'variabile del genoma di SARS-CoV-2 e' Associata a un elemento di struttura secondaria noto come s2m, che in questo coronavirus sembra avere una struttura meno Effente e definita rispetto a quella osservata in altri virus dello stesso tipo" , continua Pesole.

"Benche 'le implicazioni funzionali di queste osservazioni non siano complete chiare e' indubbio che l'applicazione su larga di CorGAT e di strumenti benzer kolaylaştırıcıları lo studio dei possibili effetti delle nuove varianti nel genoma di SARS-CoV-2, katkıda bulunan anche alla progettazione di farmaci e vaccini ”.

La rapida identificazione di ceppi virali acil o di varianti genetiche potenzialmente a nuove caratteristiche e 'uno degli obiettivi piu' importanti della "sorveglianza genomica": lo studio del genoma dei patogeni, e si application, ad esempio, per l'identificazione e caratterizzione delle cosiddette "nuove varianti del virus", venute Recentemente alla ribalta.

"La sorveglianza genomica rappresenta una delle prime linee di difesa per il controllo della diffusione dei patogeni umani ed e 'una risorsa fondamentale per lo sviluppo di terapie e vaccini", il ricercatore Cnr-Ibiom'u bitirir.

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Dire Ajansı