Transplantation de microbiote fécal (transplantation fécale) : à quoi ça sert et comment ça se passe ?

By Cristiano-Antonino On 28 février 2023

La transplantation de microbiote fécal (également connue sous le nom de «transplantation fécale») en médecine fait référence au processus par lequel les bactéries fécales et autres microbes sont transférés d'un individu sain à un autre

La greffe de microbiote fécal est un traitement efficace contre les infections causées par la bactérie Clostridioides difficile (CDI)

Cette bactérie était connue jusqu'à il y a quelques années sous le nom de Clostridium difficile.

Pour les infections récurrentes causées par cette bactérie, la transplantation de microbiote fécal est plus efficace que la thérapie avec l'antibiotique vancomycine.

Les effets secondaires peuvent inclure le risque d'infection, de sorte que le donneur doit être dépisté.

La greffe de microbiote fécal consiste à restaurer la microflore colique en introduisant une flore bactérienne saine par infusion de fèces par coloscopie, lavement, sonde orogastrique ou par voie orale sous forme de capsule contenant les fèces d'un donneur sain, dans certains cas lyophilisé.

Avec la propagation de l'ICD, la transplantation de microbiote fécal devient de plus en plus importante, certains experts demandant qu'elle devienne la thérapie de première ligne pour l'ICD.

La transplantation de microbiote fécal a été utilisée expérimentalement pour traiter d'autres maladies gastro-intestinales, notamment la colite, la constipation, le syndrome du côlon irritable et des affections neurologiques, telles que la sclérose en plaques et la maladie de Parkinson.

Aux États-Unis, les matières fécales humaines sont réglementées en tant que médicament expérimental depuis 2013.

Au Royaume-Uni, la réglementation de la transplantation de microbiote fécal relève de la responsabilité de l'Agence de réglementation des médicaments et des produits de santé.

À ce jour, l'unité opératoire de gastroentérologie du Policlinico Gemelli de Rome, dirigée par le professeur Antonio Gasbarrini, est la seule en Italie à compter la transplantation de microbiote fécal parmi les options de traitement disponibles pour les patients atteints d'une infection récurrente à Clostridioides difficile.

Qu'est-ce que le microbiote fécal ?

Le « microbiote humain » est l'ensemble des micro-organismes symbiotiques (virus, bactéries et champignons) qui coexistent avec l'organisme humain sans lui nuire, mais plutôt en le soutenant, dans une relation mutuellement bénéfique.

Le microbiote intestinal humain est la partie du microbiote humain dans l'intestin qui est importante pour notre santé.

Le « microbiote intestinal humain » est également appelé « microbiote intestinal humain » ou « microbiote fécal » et est principalement composé de bactéries.

On l'appelait autrefois « flore intestinale », mais comme elle ne se compose pas que de bactéries et que les bactéries n'appartiennent pas au règne végétal, son nom a été changé.

Contexte historique

La première utilisation des excréments de donneurs comme agent thérapeutique pour les intoxications alimentaires et la diarrhée a été enregistrée dans le Manuel de médecine d'urgence par le Chinois Ge Hong au 4ème siècle avant JC.

Deux cents ans plus tard, le médecin de la dynastie Ming, Li Shizhen, utilisait une «soupe jaune» (également appelée «sirop doré») qui contenait de l'eau et des matières fécales fraîches, séchées ou fermentées.

La soupe jaune était bue par des personnes qui présentaient des symptômes d'inconfort abdominal.

La consommation de «fèces de chameau fraîches et chaudes» était également recommandée par les Bédouins comme remède contre la dysenterie bactérienne; son efficacité probablement attribuable à la subtilisine antimicrobienne produite par Bacillus subtilis a été confirmée de manière anecdotique par des soldats allemands de l'Afrika Korps pendant la Seconde Guerre mondiale.

Cependant, cette histoire est probablement un mythe; des recherches indépendantes n'ont pu vérifier aucune de ces affirmations.

La première utilisation de la greffe de microbiote fécal en médecine occidentale a été publiée en 1958 par Ben Eiseman et ses collègues, une équipe de chirurgiens du Colorado, qui ont traité quatre personnes gravement malades atteintes de colite pseudomembraneuse fulminante (avant que Clostridioides difficile ne soit la cause connue) à l'aide de lavements fécaux, qui conduit à un retour rapide à la santé.

Pendant plus de deux décennies, la transplantation de microbiote fécal a été proposée comme option de traitement au Center for Digestive Diseases de Five Dock, par Thomas Borody, le promoteur moderne de la transplantation de microbiote fécal.

En mai 1988, leur groupe a traité le premier patient atteint de colite ulcéreuse par transplantation fécale, ce qui a entraîné une résolution complète de tous les signes et symptômes à long terme.

En 1989, ils ont traité un total de 55 patients souffrant de constipation, de diarrhée, de douleurs abdominales, de rectocolite hémorragique et de maladie de Crohn par transplantation de microbiote fécal.

Après transplantation, 20 patients ont été considérés comme « guéris » et 9 autres patients ont présenté une diminution des symptômes.

Les greffes fécales sont considérées comme efficaces à environ 90 % chez les personnes atteintes de cas graves de colonisation par Clostridioides difficile dans lesquels les antibiotiques ont échoué.

Le premier essai contrôlé randomisé sur l'infection à Clostridioides difficile a été publié en janvier 2013.

L'étude a été arrêtée prématurément en raison de l'efficacité de la transplantation de microbiote fécal, 81 % des patients ayant récupéré après une seule perfusion et plus de 90 % après une deuxième perfusion.

Depuis lors, diverses institutions ont proposé la transplantation de microbiote fécal comme option thérapeutique pour diverses affections.

Les utilisations médicales

Infections à Clostridioides difficile

La greffe de microbiote fécal est efficace pour environ 85 à 90 % chez les personnes atteintes d'ICD pour lesquelles les antibiotiques n'ont pas fonctionné ou chez qui la maladie réapparaît après la prise d'antibiotiques.

La plupart des personnes atteintes d'ICD se rétablissent grâce à un traitement de transplantation de microbiote fécal.

Une étude de 2009 a révélé que la transplantation de microbiote fécal était une procédure efficace et simple qui était plus rentable que l'administration continue d'antibiotiques et réduisait l'incidence de la résistance aux antibiotiques.

Jusqu'à il y a quelques décennies, cette procédure était considérée comme une « thérapie de dernier recours » par certains professionnels de la santé, en raison de sa nature inhabituelle, des tabous associés aux matières fécales, de son plus grand pouvoir invasif par rapport aux antibiotiques, du risque potentiel perçu de transmission d'infections et le manque de couverture fécale par les donneurs.

Actuellement, au contraire, de nombreuses prises de position d'infectiologues et de gastro-entérologues font évoluer le sentiment commun vers l'acceptation de la transplantation fécale comme traitement standard des récidives d'ICD.

Pour certains médecins, il est nécessaire d'élever la transplantation de microbiote fécal en tant que traitement de première ligne pour les personnes atteintes d'une infection à Clostridioides difficile qui se détériore et récidive sévère.

La colite ulcéreuse

Dans la rectocolite ulcéreuse, aucun agent pathogène n'a été trouvé jusqu'à présent.

Mais l'efficacité de la bactériothérapie fécale dans ce cas suggérerait que la cause de la rectocolite hémorragique pourrait être due à une infection antérieure par un agent pathogène encore inconnu.

En effet, l'infection initiale peut probablement s'être résolue naturellement chez ces patients ; mais parfois, un déséquilibre de la flore intestinale du côlon peut entraîner une poussée inflammatoire (ce qui expliquerait le caractère cyclique et récurrent de cette maladie).

Ce cycle semble, au moins dans de nombreux cas, être interrompu en recolonisant le côlon du patient avec un complexe bactérien (probiotique) prélevé sur un intestin sain (hétérogreffe).

Certains médecins estiment que ce traitement réalisé chez des sujets sains est sans danger et de nombreux patients pourraient bénéficier de cette thérapie innovante.

Une étude de mai 2011 a confirmé la bonne volonté des patients et des parents d'enfants atteints de rectocolite hémorragique à accepter ce traitement, une fois surmonté leur aversion initiale pour la méthode.

"Bien que le dégoût initial et le" facteur puah "aient été uniformément cités, ces préoccupations ont été plus que compensées par les avantages perçus."

(Kahn et al., Université de Chicago)

En 2013, une autre recherche confirme la validité de la thérapie avec une étude pilote prospective sur dix sujets âgés de 7 à 21 ans.

Cette étude démontre la tolérabilité et l'efficacité de la thérapie de transplantation fécale dans la rectocolite hémorragique ; en fait, chez sept sujets, il y a eu une rémission clinique en une semaine et six sur neuf ont maintenu une rémission clinique à un mois.

Une étude de mai 2011 a confirmé la bonne volonté des patients et des parents d'enfants atteints de rectocolite hémorragique à accepter ce traitement, une fois surmonté leur dégoût initial pour la méthode.

En mai 1988, le professeur australien Thomas Borody a traité le premier patient atteint de colite ulcéreuse à l'aide d'une greffe de microbiote fécal, ce qui a permis de résoudre des symptômes de longue date.

Par la suite, Justin D. Bennet a publié le premier rapport de cas documentant l'inversion de la colite de Bennet à l'aide de la transplantation de microbiote fécal.

Bien que Clostridioides difficile soit facilement éradiqué avec une seule perfusion de greffe fécale, cela ne semble généralement pas être le cas pour la rectocolite hémorragique.

L'expérience publiée sur le traitement de la colite ulcéreuse par transplantation de microbiote montre largement que des perfusions multiples et récurrentes sont nécessaires pour obtenir une rémission ou une guérison prolongée.

Colite pseudomembraneuse

L'importance en tant qu'agent pathogène de Clostridioides difficile est solidement établie depuis 1978, mais son importance dans le traitement de la colite pseudomembraneuse découle également du fait que son épidémiologie a récemment changé, posant de sérieux problèmes diagnostiques et thérapeutiques aux cliniciens.

Les taux d'infection ont doublé, passant de 31/100,000 1996 en 61 à 100,000/2003 XNUMX en XNUMX.

Au cours des dernières années, la gravité et la mortalité de l'infection à Clostridioides difficile ont augmenté et cela a été attribué à une nouvelle souche virulente de Clostridioides difficile connue sous le nom de souche nord-américaine d'électrophorèse sur gel en champ pulsé de type 1 (NAP-1) ou également de type PFGE. BI/NAP1 ribotype 027.

Transplantation de microbiote fécal contre l'obésité et le diabète

La dernière frontière de la transplantation de microbiote fécal est la lutte contre l'obésité et le diabète.

En fait, cette thérapie pourrait être proposée pour perdre du poids et lutter contre le diabète sucré de type 2, comme le suggère une étude de l'Université de Copenhague.

Les résultats sont prometteurs, pour l'instant, sur des souris de laboratoire.

Dans la recherche, les scientifiques ont testé sur des souris un nouveau type de transplantation fécale qui consiste à ne transférer que les virus bactériophages présents dans les échantillons de fèces des animaux, à l'exclusion des bactéries.

Les chercheurs ont extrait les fèces de souris nourries avec un régime pauvre en graisses et les ont filtrées de manière à éliminer toutes les bactéries vivantes, tout en conservant les virus bactériophages.

Le matériel résultant a été transplanté dans les intestins des souris en surpoids, qui ont continué à se nourrir comme avant pendant encore six semaines.

Les résultats ont montré que la stratégie était efficace : les receveurs réduisaient l'accumulation de graisse malgré avoir mangé les mêmes aliments qu'auparavant et voyaient leur risque de développer une intolérance au glucose, l'une des conditions qui favorisent l'apparition du diabète, diminuer.

Le professeur Dennis Sandris Nielsen, l'un des auteurs de l'étude, a déclaré: «Lorsque nous transférons des particules virales des fèces de souris maigres à des souris obèses, les souris obèses prennent beaucoup moins de poids que celles qui ne reçoivent pas les fèces transplantées.

Un autre auteur de l'étude, le professeur Torben Sølbeck Rasmussen, a déclaré: «Chez des souris obèses avec un régime riche en graisses qui n'ont pas reçu la greffe de virus, nous avons observé une tolérance réduite au glucose, un facteur précurseur du diabète.

Mais en intervenant dans le microbiote intestinal, nous avons empêché des souris aux modes de vie malsains de développer certaines des maladies courantes déclenchées par une mauvaise alimentation ».

Cancer et transplantation de microbiote fécal

Des essais cliniques sont en cours pour évaluer si la transplantation de microbiote fécal à partir de donneurs d'immunothérapie anti-PD-1 peut favoriser une réponse thérapeutique chez les patients réfractaires à l'immunothérapie.

Transplantation de microbiote fécal et trouble bipolaire

Un cas anecdotique d'une patiente atteinte d'un trouble bipolaire 1 résistant au traitement résolvant ses symptômes grâce à une transplantation de microbiote fécal a été publié par le psychiatre Russell Hinton en 2020.

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